1. Да, на данном этапе получить элементы (elements) можно только с помощью колониальной фабрики из ненужных вещей. Падают элементы в соответствии вот с этой таблицей: http://www.armadahq.com/cms/index.php?title=Smelting . Level - уровень расплавливаемой вещи. Уровень самой фабрики также влияет на количество получаемых элементов: чем он выше, тем, соответственно, больше можно получить с одной вещи. Хотя опять же, тратить элементы, кроме как на апгрейды колониальных построек, пока не на что.

2. При покупке скилла Reeducate обнуляются капитанские навыки (captain skills), а также базовые навыки (basic skills: weapon, science, tactics). Очки за них возвращаются обратно. Корабельные системы (ship systems) остаются на прежнем уровне. Влияние (influence) не возмещается.

3. Пока что никак. Система капитанских навыков ещё не введена полностью.